Система для высокопроизводительного секвенирования SURFSeq 5000, GeneMind

SURFSeq 5000 (аналог HELICON G400) — первый полногеномный NGS-секвенатор в линейке приборов, выпускаемых китайской компанией GeneMind. Благодаря наличию двух проточных ячеек и увеличенной общей производительности в 1200 Гб, на этом приборе можно отсеквенировать до 8 полных геномов человека за запуск. Также прибор рекомендуется для секвенирования экзомов и транскриптомов (около 100 за запуск) и секвенирования единичных клеток. Секвенатор работает по технологии SURF-seqTM (секвенирование осуществляется с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы). Генерация кластеров ДНК, секвенирование синтезом и детекция флуоресценции происходят в одном приборе, без выполнения ручных операций.

В данной модели секвенатора реализована функция параллельного запуска ячеек, т.е. можно запустить секвенирование образцов на второй ячейке, во время работы прибора, не дожидаясь окончания секвенирования первой ячейки.

Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения системы секвенирования SURFSeq 5000

• Секвенирование экзома (WES);
• секвенирование полных геномов (WGS) в том числе человека;
• таргетное секвенирование (большие панели генов 5-10 гб/образец);
• секвенирование транскриптома (RNAseq);
• метагеномное секвенирование (mNGS);
• анализ степени метилирования ДНК (WGBS).

Характеристики системы секвенирования SURFSeq 5000

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 2;
• количество дорожек в ячейке для секвенирования, шт. — 4;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана — наличие;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования, нуклеотида — 4;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку средней производительности (FCM), млн — 500;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку высокой производительности (FCH), млн — 2 000;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, ГБ — 1200;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений — наличие;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 47;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera — наличие;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) — 85% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 1090×690×810;
• вес, кг — 240.

Комплектация системы секвенирования SURFSeq 5000

• Секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).